Суперкомпьютерное моделирование динамики олигомеров ряда аминокислот (Gly, Ala, Trp, Val) в электромагнитном поле инфракрасного диапазона

Суперкомпьютерное моделирование методом молекулярной динамики ряда олигомеров аминокислот позволило впервые выявить для таких частиц особенности комплекса характеристик как собственных внутримолекулярных локальных колебаний (нормальных мод), так и вынужденных колебаний в растворе при задании электромагнитного поля в дальнем и среднем ИК-диапазонах, а также различных алгоритмов структуры растворителя. Для олигомеров аминокислот Gly, Ala, Trp, Val и их групп получены амплитудно-временные зависимости энергии и электрического дипольного момента, Фурье-преобразованием которых выявлены спектры частот. Впервые обнаружены и вычислены смещения спектральных пиков, вызванные различиями алгоритмов задания структуры растворителя. Интерпретация полученных закономерностей позволила предложить непротиворечивую модель, удовлетворяющую фундаментальным физическим представлениям о внутримолекулярной и межмолекулярной динамике групп биомолекул. Эта модель допускает внутримолекулярные взаимодействия нормальных локальных колебаний, в том числе по типу Ферми-резонанса.